При работе сепаратора в режиме пурификации эффективность сепарации зависит также от положения «пограничного слоя , представляющего собой границу раздела между топливом и водой.
Нормально он должен располагаться у внешней кромки распределительных отверстий дисков и ни при каких обстоятельствах не должен проходить по отверстиям и тем более правее их. В первом случае будет наблюдаться торможение потока топлива ка входе в диски, что приведет к резкому ухудшению сепарации, а во втором — в зону очищенного топлива будет поступать вода.
Эффективность сепарации повышается, когда поверхность раздела отодвигается влево от отверстий, так как в этом случае увеличивается эффективная поверхность дисков. Но в этом случае растет риск исчезновения (разрыва) водяного затвора и, как следствие, утечки топлива через водоотводной канал в грязевую цистерну. Регулировка положения «пограничного слоя» осуществляется с помощью гравитационной шайбы, устанавливаемой в верхней части корпуса барабана и оказывающей сопротивление выходу из него воды. Если установить шайбу с меньшим диаметром отверстия, давление воды на топливо в корпусе барабана сепаратора увеличится и «пограничный слой» переместится ближе к оси вращения. Поскольку давление в слое топлива зависит от его плотности, то для того, чтобы обеспечить необходимое равновесие между топливом и водой при подборе диаметра регулировочной шайбы, нужно руководствоваться значением плотности сепарируемого топлива. Обычно этой цели служат номограммы или таблицы, помещаемые в инструкции к сепараторам